Sklepy to budynki w wiosce, w których wydajesz SmoogieDollars na jajka, jedzenie, mydło, akcesoria, zabawki, mikstury i ozdoby do domu. SmoogieDollars to jedyna waluta w grze i zdobywa się je przez zadania, codzienne zajęcia, przygody, zbieranie i minigry. W wiosce są Sklep z Pupilami z jajkami gatunków podstawowych ze wszystkich rodzin, Supermarket na codzienne potrzeby, Sklep Odzieżowy z akcesoriami dla zwierzaków, Magiczny sklep ze specjalnymi przedmiotami jednorazowego użytku do opieki i wzrostu, Sklep z Zabawkami z zabawkami, które noszą twoje zwierzaki, oraz Sklep ogrodowy z nasionami, konewką i planami budowy.
Supermarket sprzedaje jeden rodzaj jedzenia dla każdej rodziny gatunków: ziarna dla ptaków, jagody, ser, surowe mięso, liście, nektar, orzeszki ziemne i ogniste kamienie. Sprzedaje też uniwersalne mydło do mycia zwierzaków. Sklep Odzieżowy ma dwie półki: kosmetyczne akcesoria dla twoich zwierzaków, które są wyłącznie ozdobą, oraz plecaki dla ciebie, będące jedynym sposobem, by nieść więcej niż podstawowe dwadzieścia miejsc w ekwipunku. Sklep z Zabawkami sprzedaje zabawki, a zabawkę trzyma jeden zwierzak, zamiast stawiać ją w domu. Trzymana zabawka podnosi maksymalną energię tego zwierzaka, a jeszcze bardziej, jeśli jest to rodzaj, który pokochał od urodzenia. Każda zabawka kosztuje 1000 SD, więc żadna ulubiona nie jest trudniejsza do zdobycia niż inna. Magiczny sklep oferuje specjalne przedmioty jednorazowego użytku wpływające na opiekę i wzrost, w tym natychmiastowe wyklucie jajka. Sklep ogrodowy sprzedaje nasiona, konewkę oraz plany stawu i trzech rozmiarów grządki, które potem budujesz przy stole warsztatowym z drewna i kamienia. Sam stół warsztatowy oraz plany najmniejszej grządki i najmniejszego stawu są darmowe, więc nikt nie zostaje odcięty od ogrodnictwa. Drzewa i rośliny pochodzą z twojego własnego ogrodu, a nie z półki.
W Sklepie z Pupilami możesz kupić jajka nowych Smoogies, ale jajek krzyżówek tam nie ma: te pochodzą z Chatki Hodowlanej. Dwa smocze jajka pozostają zablokowane na półce, dopóki nie ukończysz całej głównej historii, więc smok jest nagrodą za przejście świata, a nie za oszczędzanie. Każdego zwierzaka możesz też sprzedać na karcie Sprzedaj w Sklepie z Pupilami. Cena sprzedaży opiera się na podstawowej wartości jajka danego gatunku, z premiami za poziom rzadkości i czas spędzony jako dorosły, w tym 5 SD za każdy dzień dorosłości. Krzyżówka sprzedaje się za 1,5 wartości jajka droższego rodzica. Sprzedane zwierzaki trafiają do przechowalni. Zwierzaka z przechowalni możesz w każdej chwili odkupić na karcie Odkup za pierwotną cenę sprzedaży plus stałą opłatę za opiekę w wysokości 50 SD. Jego wiek, etap wzrostu i liczniki opieki stoją w przechowalni w miejscu, a na odkupienie nie ma terminu.